Assen ha sido fiel a su tradición y ha sido absolutamente incierto en cuanto al méteo se refiere, porque la sesión ha empezado en seco para luego tener una pista mojada, con una lluvia “in crescendo”, aunque finalmente se ha vuelto a secar la pista.
Ese hecho de que se volviese a secar la pista ha hecho que pilotos, como Efrén Vázquez, haya podido recuperarse puesto que estaba más allá de la posición 20ª.
Primera vez en la que Niklas Ajo ha conseguido poner su moto en primera línea de parrilla. El hijo del patrón está mostrando síntomas claros de mejor en las últimas carreras.
| Posición | Dorsal | Piloto | Equipo | Moto | Tiempo |
| 1 | 8 | Jack MILLER | Red Bull KTM Ajo | KTM | 1’42.240 |
| 2 | 12 | Alex MARQUEZ | Estrella Galicia 0,0 | Honda | 1’42.356 |
| 3 | 31 | Niklas AJO | Avant Tecno Husqvarna Ajo | Husqvarna | 1’42.430 |
| 4 | 10 | Alexis MASBOU | Ongetta-Rivacold | Honda | 1’42.458 |
| 5 | 23 | Niccolò ANTONELLI | Junior Team GO&FUN Moto3 | KTM | 1’42.515 |
| 6 | 42 | Alex RINS | Estrella Galicia 0,0 | Honda | 1’42.564 |
| 7 | 32 | Isaac VIÑALES | Calvo Team | KTM | 1’42.579 |
| 8 | 98 | Karel HANIKA | Red Bull KTM Ajo | KTM | 1’42.582 |
| 9 | 5 | Romano FENATI | SKY Racing Team VR46 | KTM | 1’42.594 |
| 10 | 17 | John MCPHEE | SaxoPrint-RTG | Honda | 1’42.730 |
| 11 | 52 | Danny KENT | Red Bull Husqvarna Ajo | Husqvarna | 1’42.820 |
| 12 | 33 | Enea BASTIANINI | Junior Team GO&FUN Moto3 | KTM | 1’42.822 |
| 13 | 44 | Miguel OLIVEIRA | Mahindra Racing | Mahindra | 1’42.872 |
| 14 | 84 | Jakub KORNFEIL | Calvo Team | KTM | 1’42.914 |
| 15 | 7 | Efren VAZQUEZ | SaxoPrint-RTG | Honda | 1’42.948 |
| 16 | 41 | Brad BINDER | Ambrogio Racing | Mahindra | 1’43.058 |
| 17 | 13 | Jasper IWEMA | KRP Abbink Racing | FTR KTM | 1’43.108 |
| 18 | 61 | Arthur SISSIS | Mahindra Racing | Mahindra | 1’43.176 |
| 19 | 21 | Francesco BAGNAIA | SKY Racing Team VR46 | KTM | 1’43.339 |
| 20 | 58 | Juanfran GUEVARA | Mapfre Aspar Team Moto3 | Kalex KTM | 1’43.393 |
| 21 | 9 | Scott DEROUE | RW Racing GP | Kalex KTM | 1’43.397 |
| 22 | 55 | Andrea LOCATELLI | San Carlo Team Italia | Mahindra | 1’43.468 |
| 23 | 38 | Hafiq AZMI | SIC-AJO | KTM | 1’43.552 |
| 24 | 3 | Matteo FERRARI | San Carlo Team Italia | Mahindra | 1’43.629 |
| 25 | 65 | Philipp OETTL | Interwetten Paddock Moto3 | Kalex KTM | 1’43.680 |
| 26 | 57 | Eric GRANADO | Calvo Team | KTM | 1’43.691 |
| 27 | 63 | Zulfahmi KHAIRUDDIN | Ongetta-AirAsia | Honda | 1’43.794 |
| 28 | 19 | Alessandro TONUCCI | CIP | Mahindra | 1’43.810 |
| 29 | 51 | Bryan SCHOUTEN | CIP | Mahindra | 1’43.827 |
| 30 | 11 | Livio LOI | Marc VDS Racing Team | Kalex KTM | 1’43.851 |
| 31 | 43 | Luca GRÜNWALD | Kiefer Racing | Kalex KTM | 1’43.982 |
| 32 | 95 | Jules DANILO | Ambrogio Racing | Mahindra | 1’44.514 |
| 33 | 22 | Ana CARRASCO | RW Racing GP | Kalex KTM | 1’45.077 |
| 34 | 71 | Thomas VAN LEEUWEN | 71Workx.com Racing Team | Kalex KTM | 1’45.138 |
| 35 | 4 | Gabriel RAMOS | Kiefer Racing | Kalex KTM | 1’45.943 |